Ilıcak, Cumhuriyet Savcısı Orhan Kapıcı’nın şikayeti nedeniyle yargılandığı İstanbul 15. Asliye Ceza Mahkemesi’nde görülen davada “iftira” suçundan aldığı 2 yıl 6 ay hapis cezasının istinafta onanmasının ardından cezaevine girmişti. Ilıcak, yaklaşık 2 aylık tutukluluğunun ardından tahliye edildi.
Kapatılan Özgür Düşünce isimli internet sitesinde 2016’da yazdığı “Hanefi Avcı’nın Operasyon Beklentisi” başlıklı yazı nedeniyle Nazlı Ilıcak hakkında İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından iddianame hazırlanmıştı. İddianamede Ilıcak, “iftira” ile suçlanmıştı.
İstanbul 15. Asliye Ceza Mahkemesi’nde 2021’de açılan dava, 19 Nisan 2022’de karara bağlanmıştı. Ilıcak, 2 yıl 6 ay hapis cezası almıştı.